BARLEX

Projektbeschreibung

Ziel des Projektes ist die Ergänzung / Vervollständigung einer physischen Karte des Gerstengenoms und deren Verankerung an die genetische Karte. Zur Unterstützung eines laufenden internationalen Kooperationsprojektes (Leibniz Pakt für Forschung & Innovation, IPK/ACPFG Adelaide/TU München) wird mittels der anerkannten Technik des High Information Content Fingerprinting (HICF) eine BAC Bibliothek (ca. 5-fache Repräsentation des haploiden Gerstengenoms) analysiert und in die im Aufbau befindliche physische Karte des Gerstengenoms integriert. Um eine effizient Nutzung der entstehenden Ressource zu erzielen, bedarf es der genetischen Verankerung der Contig Karte. Dies wird durch Screenings der verwendeten BAC Bibliotheken mit gen-basierten Markern und durch die Hochdurchsatz 454 Sequenzierung von 3000 BAC Klonen erzielt. Auf diese Weise werden innerhalb dieses Projektes Sequenzdaten für ca. 6% des Gerstengenoms erhoben.

Diese entstehende öffentliche Resource wird die effiziente Isolierung eines (prinzipiell) jeden Gens aus Gerste, und zu grossem Teil aus verwandten Arten wie Weizen und Roggen, erleichtern. Sie wird wesentliche, neue Einblicke in Struktur und Organisation des Gerstengenoms liefern und ausserdem als Grundlage für eine weitgehende Sequenzierung des Gerstegenoms dienen.

Partner

Dr. Nils Stein (Projektkoordinator)
Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) Gatersleben
Corrensstr. 3
06466 Gatersleben
Tel.: +49 39482-55 22
Fax: +49 39482-55 95
E-mail: stein@ipk-gatersleben.de

Dr. Matthias Platzer
Leibniz-Institut für Altersforschung - Fritz Lipmann-Institut
Beutenbergstraße 11
07745 Jena  
Tel.: +49 3641-65-6241
Fax: +49 3641-65-6255
E-mail: mplatzer@fli-leibniz.de

Dr. Klaus Mayer
Helmholtz Zentrum München
Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH)
Ingolstädter Landstr. 1
85764 Neuherberg
Tel.: +49 893 1873584
Fax: +49 893 1873585
E-mail: kmayer@gsf.de

PD Dr. Frank Ordon
Julius-Kühn-Institut Bundesforschungsinstitut für Kulturpflanzen (JKI)
Erwin-Baur-Str. 27
06484 Quedlinburg
Tel.: +49 3946 47601
Fax: +49 3946-47600
E-mail: f.ordon@bafz.de